O Programa de Pós Graduação em Ciências Odontológicas, assim denominado a partir de 2003, quando houve a fusão dos então Programas de Odontopediatria e Ortodontia, passou por uma recente reestruturação com a incorporação de mais uma área de concentração no final do ano de 2007. Dessa forma, na sua apresentação atual, o Programa é composto por três áreas de concentração, Odontopediatria, Ortodontia e Dentística Restauradora, todas com nível de Mestrado e Doutorado stricto sensu. O atual conceito CAPES, atribuído com base no relatório trienal 2004-2006, é 5. O objetivo primordial do Programa é a qualificação de recursos humanos, do ponto de vista técnico, científico e didático nas respectivas áreas que o compõem, para que os mesmos possam atuar de forma eficiente em instituições de ensino e pesquisa, e também junto a empresas de cunho público e privado. Além disso, também é objetivo do Programa investir na qualificação profissional de tal forma que o egresso possa identificar, compreender e atender as demandas da sociedade na qual está inserido.
As linhas de pesquisa do Programa contemplam as três áreas de concentração, Odontopediatria, Ortodontia e Dentística Restauradora. São elas: (1) BIOLOGIA MOLECULAR E RESPOSTA DOS TECIDOS VIVOS BUCAIS A MATERIAIS E TÉCNICA ; (2) FORMAÇÃO E DESENVOLVIMETNO CRÂNIO-DENTO-FACIAL ; (3) NOVAS TECNOLOGIAS NO DIAGNÓSTICO E TRATAMENTO DE PROBLEMAS BUCAIS ; (4) ENSAIOS LABORATORIAIS E CLÍNICOS PARA ANÁLISE DE MATERIAIS ODONTOLÓGICOS E TÉCNICAS , nas quais atuam os 18 docentes pertencentes do núcleo permanente.
A vivência interinstitucional nacional e internacional, constantemente renovada pelos docentes e discentes, tem um elevado valor contributivo ao nível científico do Programa, além de abrir portas para a realização de trabalhos em colaboração com Universidades de renome no Brasil e no exterior como a Baylor College of Dentistry (EUA), University of Bern (Bern, Suiça), University of Denmark (Dinamarca), Medical College of Georgia School of Dentistry (EUA), University of Michigan Dental School (EUA), University of Tennessee (EUA), Umea University - Faculty of Medicine (Suécia) e outras.
No final de 2009, o Programa estabeleceu uma importante parceria com a Universidade Federal do Amazonas (UFAM) com a criação de um doutorado interinstitucional (DINTER), com início programado para 2010. Esta ação de solidariedade, a qual é fortemente estimulada pela CAPES, tem por objetivo a capacitação profissional na área acadêmica de recursos humanos da região norte do país.
